Konfiguracja telefonu e-TOLLPojazd nie może być dodany do kilku kont jednocześnie, ponieważ powodowałoby to trudności z pobraniem opłaty od właściwego użytkownika.
Jeżeli podróżujesz drogą objętą systemem Videotollingu (autostradą AmberOne A1 lub autostradą A4 Katowice-Kraków), opłata jest pobierana na podstawie odczytu numeru rejestracyjnego, co znaczy, że może być pobrana wyłącznie od osoby, która ma dodany do swojego konta pojazd poruszający się w danej chwili autostradą.
Jeżeli podróżujesz drogą objętą systemem e-TOLL (autostradą A2 Konin-Stryków lub autostradą A4 Sośnica-Bielany Wrocławskie), opłata pobierana jest z konta gdzie przypisany jest pojazd na podstawie odczytu GPS z telefonu, co znaczy, że jeśli podróżujesz np. jako pasażer i nie chcesz płacić automatycznie za ten przejazd – musisz wyłączyć całkowicie aplikację Autopay przed rozpoczęciem podróży.